MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 62536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	CTTG	2	8	63	70	0 %	50 %	25 %	25 %	119355858
2	NC_008639	AGC	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
3	NC_008639	A	6	6	110	115	100 %	0 %	0 %	0 %	119355858
4	NC_008639	TC	3	6	143	148	0 %	50 %	0 %	50 %	119355858
5	NC_008639	T	7	7	205	211	0 %	100 %	0 %	0 %	119355858
6	NC_008639	AGA	2	6	222	227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
7	NC_008639	ACT	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355858
8	NC_008639	CTT	2	6	236	241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355858
9	NC_008639	TTC	2	6	381	386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355858
10	NC_008639	AGG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355858
11	NC_008639	A	7	7	422	428	100 %	0 %	0 %	0 %	119355858
12	NC_008639	ATG	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355858
13	NC_008639	A	6	6	630	635	100 %	0 %	0 %	0 %	119355858
14	NC_008639	TCG	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355858
15	NC_008639	T	6	6	775	780	0 %	100 %	0 %	0 %	119355858
16	NC_008639	A	6	6	791	796	100 %	0 %	0 %	0 %	119355858
17	NC_008639	AGG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355858
18	NC_008639	ATC	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355858
19	NC_008639	CT	3	6	856	861	0 %	50 %	0 %	50 %	119355858
20	NC_008639	AGA	2	6	894	899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
21	NC_008639	TC	3	6	927	932	0 %	50 %	0 %	50 %	119355858
22	NC_008639	ACC	2	6	945	950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355858
23	NC_008639	AAGG	2	8	963	970	50 %	0 %	50 %	0 %	119355858
24	NC_008639	GCG	2	6	998	1003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355858
25	NC_008639	CGA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
26	NC_008639	TC	3	6	1102	1107	0 %	50 %	0 %	50 %	119355858
27	NC_008639	GAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
28	NC_008639	GGC	2	6	1277	1282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355858
29	NC_008639	CT	3	6	1320	1325	0 %	50 %	0 %	50 %	119355858
30	NC_008639	CGG	2	6	1347	1352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355858
31	NC_008639	CAG	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
32	NC_008639	CGA	2	6	1416	1421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
33	NC_008639	A	8	8	1425	1432	100 %	0 %	0 %	0 %	119355858
34	NC_008639	AGA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
35	NC_008639	A	7	7	1444	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	119355858
36	NC_008639	TC	3	6	1461	1466	0 %	50 %	0 %	50 %	119355858
37	NC_008639	TGG	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008639	T	7	7	1558	1564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008639	TTC	2	6	1605	1610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008639	AAT	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008639	ATGC	2	8	1739	1746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008639	TTTTA	2	10	1793	1802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008639	CAA	3	9	1850	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008639	ACA	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008639	TAA	2	6	1876	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008639	TGA	2	6	1893	1898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355859
47	NC_008639	TTC	2	6	2130	2135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355859
48	NC_008639	T	7	7	2242	2248	0 %	100 %	0 %	0 %	119355859
49	NC_008639	A	7	7	2271	2277	100 %	0 %	0 %	0 %	119355859
50	NC_008639	ATG	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355859
51	NC_008639	TAGAAG	2	12	2466	2477	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119355859
52	NC_008639	GC	3	6	2501	2506	0 %	0 %	50 %	50 %	119355859
53	NC_008639	TC	3	6	2509	2514	0 %	50 %	0 %	50 %	119355859
54	NC_008639	TTCG	2	8	2576	2583	0 %	50 %	25 %	25 %	119355859
55	NC_008639	CA	3	6	2587	2592	50 %	0 %	0 %	50 %	119355859
56	NC_008639	AAT	2	6	2594	2599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355859
57	NC_008639	TCG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355859
58	NC_008639	GATC	2	8	2687	2694	25 %	25 %	25 %	25 %	119355859
59	NC_008639	CGATT	2	10	2764	2773	20 %	40 %	20 %	20 %	119355859
60	NC_008639	AGG	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355859
61	NC_008639	CAG	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355859
62	NC_008639	TTA	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355859
63	NC_008639	ATA	2	6	3022	3027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355859
64	NC_008639	T	6	6	3128	3133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008639	CAATA	2	10	3141	3150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008639	TAT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008639	A	7	7	3198	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008639	TTCT	2	8	3214	3221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008639	T	9	9	3270	3278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008639	AAT	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008639	CTT	2	6	3381	3386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
72	NC_008639	CATT	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	119355860
73	NC_008639	ATT	2	6	3499	3504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
74	NC_008639	AG	3	6	3570	3575	50 %	0 %	50 %	0 %	119355860
75	NC_008639	TAA	3	9	3596	3604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355860
76	NC_008639	A	6	6	3612	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	119355860
77	NC_008639	AGAA	2	8	3695	3702	75 %	0 %	25 %	0 %	119355860
78	NC_008639	ATT	2	6	3720	3725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
79	NC_008639	A	6	6	3738	3743	100 %	0 %	0 %	0 %	119355860
80	NC_008639	TTC	3	9	3775	3783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
81	NC_008639	CTT	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
82	NC_008639	A	8	8	3814	3821	100 %	0 %	0 %	0 %	119355860
83	NC_008639	TCT	2	6	3822	3827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
84	NC_008639	A	6	6	3939	3944	100 %	0 %	0 %	0 %	119355860
85	NC_008639	GAA	2	6	3957	3962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355860
86	NC_008639	TAT	2	6	4035	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
87	NC_008639	ATG	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355860
88	NC_008639	GAT	2	6	4107	4112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355860
89	NC_008639	TA	3	6	4122	4127	50 %	50 %	0 %	0 %	119355860
90	NC_008639	A	7	7	4142	4148	100 %	0 %	0 %	0 %	119355860
91	NC_008639	ACG	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355860
92	NC_008639	TCT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
93	NC_008639	GAC	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355860
94	NC_008639	TC	3	6	4295	4300	0 %	50 %	0 %	50 %	119355860
95	NC_008639	AGA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355860
96	NC_008639	ATT	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
97	NC_008639	GTT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355861
98	NC_008639	TGA	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355861
99	NC_008639	GTT	2	6	4525	4530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355861
100	NC_008639	A	6	6	4644	4649	100 %	0 %	0 %	0 %	119355861
101	NC_008639	GAG	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355861
102	NC_008639	CAA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008639	AGT	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008639	A	6	6	4781	4786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008639	AAG	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008639	A	6	6	4799	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008639	ATCCA	2	10	4919	4928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008639	TTC	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008639	GCT	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008639	A	8	8	5069	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008639	ACC	2	6	5124	5129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355862
112	NC_008639	TTG	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355862
113	NC_008639	TCC	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355862
114	NC_008639	ACAA	2	8	5220	5227	75 %	0 %	0 %	25 %	119355862
115	NC_008639	ATGCAA	2	12	5344	5355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119355862
116	NC_008639	GGC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355862
117	NC_008639	TGA	2	6	5506	5511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355862
118	NC_008639	TCG	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355862
119	NC_008639	A	6	6	5586	5591	100 %	0 %	0 %	0 %	119355862
120	NC_008639	GAC	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355862
121	NC_008639	AAG	2	6	5711	5716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355862
122	NC_008639	AAC	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355862
123	NC_008639	T	6	6	6074	6079	0 %	100 %	0 %	0 %	119355862
124	NC_008639	GAA	2	6	6363	6368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355863
125	NC_008639	TTCT	2	8	6413	6420	0 %	75 %	0 %	25 %	119355863
126	NC_008639	GGA	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355863
127	NC_008639	TCCA	2	8	6536	6543	25 %	25 %	0 %	50 %	119355863
128	NC_008639	CAT	2	6	6548	6553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355863
129	NC_008639	GA	3	6	6577	6582	50 %	0 %	50 %	0 %	119355863
130	NC_008639	CCTG	2	8	6583	6590	0 %	25 %	25 %	50 %	119355863
131	NC_008639	GCC	2	6	6623	6628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119355863
132	NC_008639	A	6	6	6725	6730	100 %	0 %	0 %	0 %	119355863
133	NC_008639	CCAA	2	8	6757	6764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008639	A	6	6	6795	6800	100 %	0 %	0 %	0 %	119355864
135	NC_008639	ACA	2	6	6812	6817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355864
136	NC_008639	TCC	2	6	6902	6907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355864
137	NC_008639	GCG	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355864
138	NC_008639	ATC	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355864
139	NC_008639	TGC	2	6	7268	7273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355864
140	NC_008639	CAGC	2	8	7305	7312	25 %	0 %	25 %	50 %	119355864
141	NC_008639	T	7	7	7362	7368	0 %	100 %	0 %	0 %	119355864
142	NC_008639	CA	3	6	7381	7386	50 %	0 %	0 %	50 %	119355864
143	NC_008639	CCA	2	6	7406	7411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355864
144	NC_008639	GAAC	2	8	7627	7634	50 %	0 %	25 %	25 %	119355864
145	NC_008639	ACA	2	6	7775	7780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355864
146	NC_008639	GTG	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119355864
147	NC_008639	CAA	3	9	7947	7955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355864
148	NC_008639	CCT	2	6	7970	7975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355864
149	NC_008639	TGC	2	6	8006	8011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355864
150	NC_008639	CAG	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355864
151	NC_008639	TGAT	2	8	8132	8139	25 %	50 %	25 %	0 %	119355864
152	NC_008639	ATC	3	9	8162	8170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355864
153	NC_008639	AGG	2	6	8219	8224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355864
154	NC_008639	TCA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355864
155	NC_008639	TCGT	2	8	8299	8306	0 %	50 %	25 %	25 %	119355864
156	NC_008639	CAG	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355864
157	NC_008639	ACC	2	6	8326	8331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355864
158	NC_008639	ACC	2	6	8373	8378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355865
159	NC_008639	GAA	2	6	8442	8447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355865
160	NC_008639	GC	3	6	8448	8453	0 %	0 %	50 %	50 %	119355865
161	NC_008639	TCCAGC	2	12	8617	8628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119355865
162	NC_008639	GCG	2	6	8808	8813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355865
163	NC_008639	GCA	2	6	8814	8819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355865
164	NC_008639	AG	3	6	8820	8825	50 %	0 %	50 %	0 %	119355865
165	NC_008639	TTG	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355865
166	NC_008639	CTG	2	6	8850	8855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355865
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170	NC_008639	CAAC	2	8	8921	8928	50 %	0 %	0 %	50 %	119355865
171	NC_008639	CAT	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355865
172	NC_008639	TCA	2	6	8947	8952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355865
173	NC_008639	ACC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355865
174	NC_008639	CGA	2	6	8996	9001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355865
175	NC_008639	GCT	2	6	9029	9034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355865
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178	NC_008639	A	6	6	9140	9145	100 %	0 %	0 %	0 %	119355865
179	NC_008639	TGC	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_008639	CT	3	6	9286	9291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_008639	TAACT	2	10	9301	9310	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_008639	GGC	2	6	9421	9426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355866
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188	NC_008639	GGA	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355866
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191	NC_008639	AAG	2	6	9783	9788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355866
192	NC_008639	CTT	2	6	9872	9877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355866
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195	NC_008639	TGTT	2	8	9950	9957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
196	NC_008639	GAA	2	6	9968	9973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_008639	AAAT	2	8	9991	9998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_008639	AAC	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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200	NC_008639	ACC	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
201	NC_008639	GCTGAT	2	12	10390	10401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119355867
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224	NC_008639	ATA	2	6	11639	11644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_008639	AAG	2	6	11865	11870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355869
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232	NC_008639	CTA	2	6	12327	12332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355869
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237	NC_008639	A	6	6	12613	12618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_008639	TTATT	2	10	12643	12652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_008639	ACA	2	6	12662	12667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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241	NC_008639	CCAAC	2	10	12718	12727	40 %	0 %	0 %	60 %	119355870
242	NC_008639	CAA	2	6	12728	12733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355870
243	NC_008639	A	6	6	12782	12787	100 %	0 %	0 %	0 %	119355870
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253	NC_008639	CAG	2	6	13229	13234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355870
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256	NC_008639	AG	3	6	13475	13480	50 %	0 %	50 %	0 %	119355870
257	NC_008639	CGG	2	6	13507	13512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355870
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259	NC_008639	ATT	2	6	13544	13549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355870
260	NC_008639	GAG	2	6	13550	13555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355870
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262	NC_008639	CCG	2	6	13579	13584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119355870
263	NC_008639	TCA	2	6	13680	13685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355870
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266	NC_008639	AAGAC	2	10	14270	14279	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_008639	CT	3	6	14337	14342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
268	NC_008639	ATT	2	6	14358	14363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355871
269	NC_008639	GGT	2	6	14371	14376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119355871
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271	NC_008639	GA	3	6	14544	14549	50 %	0 %	50 %	0 %	119355871
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391	NC_008639	ATC	2	6	20402	20407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_008639	A	6	6	20441	20446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_008639	GAAT	2	8	20669	20676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
398	NC_008639	GA	3	6	20737	20742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
399	NC_008639	ATA	2	6	20746	20751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_008639	T	7	7	20838	20844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_008639	GA	3	6	20887	20892	50 %	0 %	50 %	0 %	119355875
404	NC_008639	CCTTG	2	10	20935	20944	0 %	40 %	20 %	40 %	119355875
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